Ban đầu Carl Peter Thunberg phân loại kim quất là Citrus japonica trong sách Flora Japonica của ông xuất bản năm 1784. Năm 1915, Walter T. Swingle phân loại lại sang một chi riêng, gọi là Fortunella để vinh danh Robert Fortune. Nói chung người ta từng công nhận 6 loài thuộc chi Fortunella là kim quất quả tròn hay kim quất (F. japonica), kim quất quả dài (F. margarita), kim quất Miewa (F. crassifolia), kim quất Hồng Kông (F. hindsii), kim quất Giang Tô (F. obovata) và kim quất Mã Lai (F. polyandra). Sách Quần thực vật Trung Hoa đưa kim quất trở lại chi Citrus và kết hợp tất cả các loài thành một loài duy nhất với danh pháp Citrus japonica.[2]